第二次世界大战爆发后，巴多利奥参加了侵略战争计划的制定。后因侵略希腊失败及与墨索里尼发生分歧而于1940年12月辞职。辞职后一直赋闲在家，直到1943年7月，参加了推翻墨索里尼的政变，被国王任命为新政府首相。
1943年9月，他主持政府与同盟国谈判并签订了停战协定，然后领导意大利参加反法西斯战争。1944年6月5日，因与各派力量发生分歧，辞去首相职务，从此便脱离了军、政界。他虽然是法西斯时代的军人代表，但最后能迷途知返，反戈一击，使意大利从灾难中获得新生，因此获得较高评价。
一次大战崭露头角
巴多利奥经过军事院校的学习和在军中多年服役，军事理论和指挥才能有了很大提高，而第一次世界大战的爆发则给了他显露军事才干的天赐良机。
1915年5月，意大利在经过近一年的中立后，出于自身的利益，正式参战。意军在意奥边境部署了35个师87万人的兵力。意军虽较对面的奥匈军队占明显优势，但在战斗训练和技术装备上远逊于对手。从1915年6月至1916年意军共发动了五次伊松佐河战役，付出了重大伤亡，但均未获得进展，意奥战线也转入了阵地战对峙。5月，奥军发动特伦蒂诺战役，很快突破意军防线，意军溃败，损兵折将近15万人。意大利国内震动，萨兰德内阁倒台，由博泽利组成新政府。
